Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca4bQ3UW98 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca4bQ3UW98 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms