Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW31

Pate2, Prostate and testis expressed protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate2Q3UW31 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pate2Q3UW31 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms