Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnga4Q3UW12 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnga4Q3UW12 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnga4Q3UW12 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnga4Q3UW12 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnga4Q3UW12 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnga4Q3UW12 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga4Q3UW12 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga4Q3UW12 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga4Q3UW12 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga4Q3UW12 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga4Q3UW12 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga4Q3UW12 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga4Q3UW12 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga4Q3UW12 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga4Q3UW12 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga4Q3UW12 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga4Q3UW12 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga4Q3UW12 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga4Q3UW12 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga4Q3UW12 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga4Q3UW12 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga4Q3UW12 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga4Q3UW12 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga4Q3UW12 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnga4Q3UW12 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnga4Q3UW12 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms