Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nr1d1Q3UV55 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr1d1Q3UV55 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms