Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3UPC7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3UPC7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3UPC7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3UPC7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3UPC7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3UPC7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3UPC7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms