Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrc4Q3UP24 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrc4Q3UP24 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms