Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gpr55Q3UJF0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gpr55Q3UJF0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gpr55Q3UJF0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gpr55Q3UJF0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gpr55Q3UJF0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gpr55Q3UJF0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gpr55Q3UJF0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gpr55Q3UJF0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gpr55Q3UJF0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gpr55Q3UJF0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gpr55Q3UJF0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gpr55Q3UJF0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gpr55Q3UJF0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gpr55Q3UJF0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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