Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm648Q3UJ22 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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