Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Yipf3Q3UDR8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms