Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brf2Q3UAW9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms