Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trip13Q3UA06 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.1 ms