Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ssbp4Q3U4B1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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