Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hectd3Q3U487 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms