Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kdm4dQ3U2K5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms