Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms