Protein–RNA interactions for Protein: Q3I5G5

Foxi2, Forkhead box protein I2, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxi2Q3I5G5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Foxi2Q3I5G5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Foxi2Q3I5G5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Foxi2Q3I5G5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxi2Q3I5G5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms