Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms