Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms