Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sox9Q04887 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms