Protein–RNA interactions for Protein: Q03526

Itk, Tyrosine-protein kinase ITK/TSK, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItkQ03526 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItkQ03526 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItkQ03526 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItkQ03526 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ItkQ03526 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItkQ03526 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItkQ03526 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItkQ03526 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItkQ03526 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms