Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crisp3Q03402 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms