Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdcd1Q02242 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms