Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PrkcqQ02111 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms