Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa1Q00623 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms