Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim43bP86448 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms