Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ElocP83940 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ElocP83940 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ElocP83940 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ElocP83940 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ElocP83940 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ElocP83940 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ElocP83940 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ElocP83940 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ElocP83940 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ElocP83940 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ElocP83940 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ElocP83940 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ElocP83940 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ElocP83940 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ElocP83940 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ElocP83940 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ElocP83940 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ElocP83940 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ElocP83940 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ElocP83940 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ElocP83940 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ElocP83940 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ElocP83940 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ElocP83940 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ElocP83940 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ElocP83940 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ElocP83940 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ElocP83940 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ElocP83940 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ElocP83940 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ElocP83940 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ElocP83940 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ElocP83940 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ElocP83940 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ElocP83940 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ElocP83940 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ElocP83940 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ElocP83940 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ElocP83940 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ElocP83940 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ElocP83940 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ElocP83940 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ElocP83940 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ElocP83940 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ElocP83940 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ElocP83940 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ElocP83940 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ElocP83940 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ElocP83940 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ElocP83940 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ElocP83940 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ElocP83940 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ElocP83940 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ElocP83940 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ElocP83940 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ElocP83940 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ElocP83940 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ElocP83940 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ElocP83940 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ElocP83940 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ElocP83940 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ElocP83940 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ElocP83940 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ElocP83940 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ElocP83940 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ElocP83940 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ElocP83940 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ElocP83940 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ElocP83940 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ElocP83940 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ElocP83940 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ElocP83940 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ElocP83940 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ElocP83940 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ElocP83940 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ElocP83940 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ElocP83940 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ElocP83940 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ElocP83940 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ElocP83940 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ElocP83940 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ElocP83940 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ElocP83940 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ElocP83940 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ElocP83940 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ElocP83940 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ElocP83940 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ElocP83940 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ElocP83940 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ElocP83940 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ElocP83940 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ElocP83940 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ElocP83940 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ElocP83940 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ElocP83940 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ElocP83940 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ElocP83940 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ElocP83940 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ElocP83940 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms