Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx1P83917 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx1P83917 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx1P83917 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx1P83917 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cbx1P83917 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cbx1P83917 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cbx1P83917 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cbx1P83917 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cbx1P83917 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cbx1P83917 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cbx1P83917 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cbx1P83917 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cbx1P83917 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cbx1P83917 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms