Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx1P81068 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx1P81068 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx1P81068 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx1P81068 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms