Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stra8P70278 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stra8P70278 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stra8P70278 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stra8P70278 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Stra8P70278 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stra8P70278 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms