Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SbdsP70122 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SbdsP70122 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SbdsP70122 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SbdsP70122 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SbdsP70122 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SbdsP70122 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SbdsP70122 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SbdsP70122 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms