Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acta1P68134 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta1P68134 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta1P68134 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Acta1P68134 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta1P68134 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta1P68134 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acta1P68134 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acta1P68134 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Acta1P68134 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acta1P68134 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms