Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps28P62858 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps28P62858 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps28P62858 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps28P62858 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps28P62858 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps28P62858 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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