Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsnl1P62761 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms