Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Acta2P62737 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acta2P62737 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acta2P62737 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Acta2P62737 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acta2P62737 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acta2P62737 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Acta2P62737 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acta2P62737 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acta2P62737 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acta2P62737 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acta2P62737 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Acta2P62737 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Acta2P62737 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Acta2P62737 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Acta2P62737 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acta2P62737 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Acta2P62737 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Acta2P62737 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acta2P62737 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Acta2P62737 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acta2P62737 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acta2P62737 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acta2P62737 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Acta2P62737 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acta2P62737 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acta2P62737 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acta2P62737 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Acta2P62737 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acta2P62737 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Acta2P62737 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Acta2P62737 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acta2P62737 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acta2P62737 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Acta2P62737 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acta2P62737 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acta2P62737 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acta2P62737 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acta2P62737 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acta2P62737 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Acta2P62737 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acta2P62737 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acta2P62737 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acta2P62737 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms