Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps29P62274 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps29P62274 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps29P62274 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
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