Protein–RNA interactions for Protein: P61089

Ube2n, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2nP61089 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ube2nP61089 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2nP61089 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms