Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sem1P60897 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sem1P60897 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sem1P60897 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sem1P60897 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sem1P60897 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sem1P60897 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sem1P60897 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sem1P60897 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sem1P60897 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sem1P60897 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms