Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms