Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sh3bp1P55194 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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