Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms