Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GemP55041 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GemP55041 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GemP55041 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GemP55041 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GemP55041 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GemP55041 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GemP55041 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GemP55041 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GemP55041 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GemP55041 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GemP55041 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GemP55041 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GemP55041 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GemP55041 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GemP55041 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GemP55041 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GemP55041 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GemP55041 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GemP55041 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GemP55041 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GemP55041 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GemP55041 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GemP55041 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GemP55041 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GemP55041 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GemP55041 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GemP55041 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GemP55041 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GemP55041 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GemP55041 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GemP55041 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GemP55041 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GemP55041 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GemP55041 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GemP55041 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GemP55041 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GemP55041 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GemP55041 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GemP55041 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GemP55041 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GemP55041 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GemP55041 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GemP55041 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GemP55041 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GemP55041 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GemP55041 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GemP55041 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GemP55041 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GemP55041 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GemP55041 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GemP55041 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GemP55041 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GemP55041 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GemP55041 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GemP55041 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GemP55041 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GemP55041 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GemP55041 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GemP55041 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GemP55041 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GemP55041 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GemP55041 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GemP55041 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GemP55041 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GemP55041 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GemP55041 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GemP55041 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GemP55041 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GemP55041 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GemP55041 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GemP55041 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GemP55041 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GemP55041 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GemP55041 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GemP55041 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GemP55041 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GemP55041 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GemP55041 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GemP55041 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GemP55041 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GemP55041 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GemP55041 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GemP55041 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GemP55041 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GemP55041 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GemP55041 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GemP55041 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GemP55041 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GemP55041 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GemP55041 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GemP55041 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GemP55041 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GemP55041 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GemP55041 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GemP55041 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GemP55041 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GemP55041 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GemP55041 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GemP55041 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms