Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PctpP53808 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PctpP53808 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PctpP53808 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PctpP53808 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PctpP53808 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PctpP53808 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PctpP53808 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PctpP53808 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PctpP53808 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PctpP53808 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PctpP53808 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PctpP53808 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PctpP53808 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PctpP53808 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PctpP53808 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PctpP53808 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PctpP53808 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PctpP53808 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PctpP53808 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PctpP53808 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PctpP53808 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PctpP53808 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PctpP53808 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PctpP53808 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PctpP53808 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PctpP53808 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PctpP53808 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PctpP53808 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PctpP53808 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PctpP53808 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PctpP53808 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PctpP53808 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PctpP53808 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PctpP53808 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PctpP53808 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PctpP53808 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PctpP53808 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PctpP53808 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PctpP53808 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PctpP53808 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PctpP53808 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PctpP53808 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PctpP53808 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PctpP53808 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PctpP53808 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PctpP53808 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PctpP53808 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PctpP53808 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PctpP53808 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PctpP53808 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PctpP53808 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PctpP53808 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PctpP53808 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PctpP53808 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PctpP53808 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PctpP53808 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PctpP53808 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PctpP53808 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PctpP53808 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PctpP53808 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PctpP53808 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PctpP53808 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PctpP53808 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PctpP53808 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PctpP53808 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PctpP53808 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PctpP53808 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PctpP53808 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PctpP53808 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PctpP53808 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PctpP53808 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PctpP53808 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PctpP53808 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PctpP53808 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PctpP53808 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PctpP53808 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PctpP53808 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PctpP53808 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PctpP53808 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PctpP53808 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PctpP53808 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PctpP53808 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PctpP53808 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PctpP53808 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PctpP53808 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PctpP53808 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PctpP53808 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PctpP53808 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PctpP53808 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PctpP53808 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PctpP53808 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PctpP53808 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PctpP53808 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PctpP53808 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PctpP53808 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PctpP53808 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PctpP53808 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PctpP53808 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PctpP53808 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms