Protein–RNA interactions for Protein: P52482

Ube2e1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e1P52482 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ube2e1P52482 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ube2e1P52482 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ube2e1P52482 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ube2e1P52482 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms