Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab11bP46638 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11bP46638 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms