Protein–RNA interactions for Protein: P43241

Cdx2, Homeobox protein CDX-2, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx2P43241 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdx2P43241 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms