Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stfa3P35173 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stfa3P35173 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stfa3P35173 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stfa3P35173 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stfa3P35173 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Stfa3P35173 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stfa3P35173 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stfa3P35173 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stfa3P35173 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stfa3P35173 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stfa3P35173 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stfa3P35173 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stfa3P35173 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stfa3P35173 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stfa3P35173 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stfa3P35173 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stfa3P35173 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stfa3P35173 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stfa3P35173 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stfa3P35173 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stfa3P35173 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stfa3P35173 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stfa3P35173 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stfa3P35173 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stfa3P35173 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stfa3P35173 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stfa3P35173 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stfa3P35173 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stfa3P35173 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stfa3P35173 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Stfa3P35173 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stfa3P35173 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stfa3P35173 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stfa3P35173 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stfa3P35173 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stfa3P35173 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stfa3P35173 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stfa3P35173 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stfa3P35173 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stfa3P35173 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stfa3P35173 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stfa3P35173 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stfa3P35173 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stfa3P35173 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stfa3P35173 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stfa3P35173 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stfa3P35173 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stfa3P35173 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stfa3P35173 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stfa3P35173 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Stfa3P35173 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stfa3P35173 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stfa3P35173 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stfa3P35173 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stfa3P35173 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stfa3P35173 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stfa3P35173 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms