Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rom1P32958 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rom1P32958 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rom1P32958 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rom1P32958 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rom1P32958 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rom1P32958 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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