Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms