Protein–RNA interactions for Protein: P29268

Ctgf, Connective tissue growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtgfP29268 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtgfP29268 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtgfP29268 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtgfP29268 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtgfP29268 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtgfP29268 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtgfP29268 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms