Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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